Idea-idea al-Faruqi mengenai Islamisasi ilmu pengetahuan terus mempengaruhi pemikiran Islam kontemporari. Penekanannya pada integrasi prinsip-prinsip Islam dengan disiplin akademik moden kekal relevan bagi sarjana dan pendidik yang bertujuan untuk menyelaraskan iman dan akal. Kerjanya sering dirujuk dalam persidangan akademik dan penerbitan mengenai pemikiran dan pendidikan Islam.[40][41][42]

Sumbangan al-Faruqi kepada dialog antara agama juga diakui secara meluas. Usaha beliau untuk mempromosikan pemahaman dan kerjasama bersama antara komuniti agama yang berbeza telah dicatatkan dalam beberapa karya ilmiah. Pendekatan beliau terhadap dialog antara agama, yang menekankan persamaan antara Islam, Kristian, dan Yahudi, dianggap sebagai sumbangan penting untuk memupuk persekitaran global yang damai dan saling menghormati.[43][44]

Sumbangan beliau kepada komuniti Muslim di Montreal dan pengaruhnya terhadap kesarjanaan Islam telah diakui selepas kematiannya.[45]